《命令与征服4泰伯利亚的黄昏》的故事主要是发生在《命令与征服3泰伯利亚战争》之后，当2062年人类正濒于灭绝的危机之中，地球仅剩下6年的时间可以居住。这时，两个对立的派别——全球防御组织（gdi）与nod兄弟会(nod)终于发现他们必须阻止泰伯利亚扩散，以避免最终毁灭人类；nod的领导者凯恩决定朝gdi出发，到底凯恩计划在他敌人的地盘做些什么呢？《命令与征服4》将为这个泰伯利亚世界带来最后的史诗级结局，玩家终将了解包括nod、gdi与地球的最终命运，还有最重要的、就是在凯恩长久计划下的真正动机。