《3days 満ちてゆく刻の彼方で》故事的舞台綾篠市自古作为城下町而一直繁荣。明治維新后，随着现代化的推进，其纺织工业逐渐兴盛。由于其地处由山围成的盆地，对周围区域来说，是交通，商贸往来的重要城市。市中心的綾篠公園是一个自然公园由篠蔓之池这样一个大块水域围成。是市民休憩，约会的重要场所，公园旁边的小山上是男女主人公上学的綾篠学園。据传说其建校时间为明治31年，有着悠久的历史和传统。其前身为基督教名门女子私立学校。（怎么咋像旅游景点介绍...）随着市内人口增加，政府为满足生源需要，故改变其经营模式，改建为普通公立学校。其体制也改为男女混合学校。美丽，和谐的城市生活中，暗藏着不安的阴影:美少女「柊　美柚」的尸体被发现，从綾篠学園楼顶上逝去的生命「吾妻　梨花」。为了结束在这一城市中发生的惨剧，结束这一无休止的噩梦。故事就这样开始了。（古都旅游介绍总算译完了...）被红色的落叶以及清新的空气包围着的綾篠市。在市内的学校上学的高梨　亮以及青梅竹马 藤見　たまき过着平静而快乐的生活。たまき对自己表明了好感，因为是青梅竹马的缘故，亮迟迟不能决意。就这样“朋友以上，恋人未满”的关系持续着，突然，街道上发生了怪事。2人的学校綾篠学園里有名的美少女的尸体被发现了。对这一事件，学園里的同学们产生了许多的流言，学園里交织着各种不同的推测。